Protein ZmARF9 | |
---|---|
Information | |
TF Name: | ZmARF9 |
Species: | Maize |
TF Family: | ARF |
Gene Name(Synonym): | ARFTF9 |
Uniprot ID: | B8A0C3 |
Subgenome: | 2 |
ZmARF9 is a protein in the ARF family.
Overview of domains present in v5 transcripts | |||
---|---|---|---|
PF02309 | PF02362 | PF06507 | |
Zm00001eb136130_T001 | |||
Zm00001eb136130_T002 | |||
Zm00001eb136130_T003 |
Gene ID | Type | MEME Logo | Sequence | FIMO | Position |
---|---|---|---|---|---|
Zm00001d041497 | DAPseq | sequence | fimo | position | |
Zm00001d041497 | DAPseq | sequence | fimo | position | |
Zm00001d041497 | ChIPseq | sequence | fimo | position | |
Zm00001d041497 | PChIPseq | sequence | fimo | position |
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Secondary Structure Color Code | |
---|---|
BEND | region with high backbone curvature without specific hydrogen bonding |
HELX_LH_PP_P | left-handed polyproline helix |
HELX_RH_3T_P | right-handed 3-10 helix |
HELX_RH_AL_P | right-handed alpha helix |
HELX_RH_PI_P | right-handed pi helix |
STRN | beta strand |
TURN_TY1_P | type I turn |
UNDETERMINED | no data available |
Domains Present | |
---|---|
PF02362 |
|
PF02362 |
|
PF06507 |
|
PF02309 |
|
PF02309 |
|
PF02362 |
|
Hover here to show all domains |
AAGAGAGGGGAAAAAAGAAGAAAGA...
AAGAGAGGGGAAAAAAGAAGAAAGAAAGCAAGGAGCACCGCACCACTCCACTCCACTTCCCTCCTCGATCCAGCCATGGCGGCCTAGGCCCCCTAGGGTTCCCTGTCAGCCCCCACCCAGGCGCCTCCTGCCGCTTCCTCCGCTCCCACCCGGTGGTCGCGCTGCCCGATTCGGCCGCCGGCGTCGAATGGGAGGCGACCCGATGCTCGAAGCCGGCCGTTGCCGCGCGCTGCCGACGGAGATTCCCTGAGCTCGGCGGCGGGTTCCCGTGCTCGCCGAGCGATGACTCTCGGCGCCGGCGCTGCCCAAGGCACTGGGTCTAGGGCGCGTGGCTGGTTGGGAGCGCGCCGTGCGTGCAATGGGGGATTTAAGGCGGTTCTGTAGAGTCGCCGCGGCGGTCTTGGTTCTGCGAGCGCGTGGCCTGCGCTCGTGAAGGTAGGGCTGTCTAGCTGCTCCTTCGTCTGATGAGCTCAGCTTCTGCGTCCCGCCTCGTTTTGTGCCCGCGTTTGCTCCGGCGGCTGCCCAAAGCCCAGCGGATCGGGCCCTGCTCATTTCGGCGCTTCTCTTCGGTTCTTTGTGGAAAGGGAGGAGCTGTGAGGTGTTGCTTGGCGAGGGTGCGCAGCTGAGGATTCCGGGCATGAGGTCAGCAATGACGCGCATTTGTCGCGACAGGCCGGAATTCGAGTAGCGGTTTCTTGAAGTGGATTGGCTGCTGCTGCGTGGGAAGGGGGAAGCGGCGGCATCAACAGCCGCAGAGGAAGGCTTACTCTGAAGCGGAGGGGAAGCAGGCTGGCATTGCTACTGGGAGCATGGCGAGGTGCTAAGGACGTGCAGGTTCCGCAATCACCGCATCTTGGTGTTCTTGTTTCAGGTCGTAGTGGGAGATGAACCTCTCACCGCCCAGGATGTCGGAGCCATCGCTTGAAAGTGACGGGGAACAAAGGTGTCTGAACTCGGAGCTATGGCATGCATGCGCAGGGCCCCTTGTGTCCCTTCCTGTGGTTGGGAGCCGGGTCGTCTACTTTCCCCAGGGCCATAGTGAGCAGGTTGCTGCATCAACTAATAAAGAAGTTGACGCTCAGATCCCAAACTACCCAAACCTACCTCCACAATTAATCTGCCAGCTTCATAATGTCACAATGCATGCTGATGCAGAGACTGGAGAGGTTTATGCCCAGATGACACTGCAACCATTGAGCCCGGAAGAGCAAAAGGAACCTTTTCTTCCAATTGAATTGGGTGCTGGTAGCAACCAGCCAACTAATTACTTCTGCAAGACGTTGACTGCAAGTGATACGAGTACCCATGGCGGGTTCTCTGTTCCACGCCGAGCAGCTGAGAAAGTCTTCCCCCCATTGGATTTTTCACAACACCCTCCAGTGCAAGAGCTGGTTGCAAGAGATCTGCATGATAATGAGTGGAAATTCCGCCACATTTTTCGTGGTCAGCCAAAAAGGCATCTACTGACGACTGGTTGGAGTGTTTTTGTAAGCGCAAAAAGACTAGTAGCAGGGGATTCTATCATATTTATCTGGAATGATAATAACCAGCTTCTATTGGGAATTCGTCGAGCAAATCGTCCACAGACTGTTATGCCCTCTTCCGTGCTATCAAGCGATAGCATGCACATTGGTCTCCTTGCTGCAGCAGCTCATGCTGCAGCCACAAACAGTCGTTTCACTATTTTCTACAACCCCCGGGCCAGCCCTTCTGAGTTTGTGATTCCACTGGCTAAGTATGTGAAAGCTGTCTACCACACACGTGTGTCTGTTGGAATGCGGTTTCGGATGCTTTTTGAGACAGAGGAATCAAGCGTCAGACGATACATGGGTACGATCACATGCATAAGTGATCTGGACTCAGAGCGTTGGCCAAATTCACACTGGCGTTCTGTGAAGGTTGGTTGGGATGAGTCTACAGCTGGTGATAAACAGCCAAGAGTTTCACTCTGGGAGATTGAACCACTGATGGCCTTTCCGATGTACCCAACTGCCTTTCCATTAAGGCTAAAGCGTCCGTGGGCTTCAGGGCTACCTATGTTCAATGGTGGGAGGAGTGATGAGTTCGCTCGTTATTCTTCTCTCATGTGGCTCCGAGATGGAAACAGAGGGGCTCAATCACTGAACTTCCAGGGACTTGGAGCATCACCATGGCTTCAACCAAGAATAGATTATCCATTATTAGGTCTGAAGCTAGATACTTACCAGCAGATGGCTGCTGCTGCACTGGAAGAAATTAGAGCTGGGGATCATTTGAAGCAGATATCTTCTCTCCTGCCAGTGCAACAGCCACAAAATTTGAGTGGTGGATTAGATCCTTTATATGGAAATCCTGTTCTGCAGCAGATGCAGTTCCAATCTCAGCAGTCATCCTTGCAAGTTGTGCAGCAAGGTTATGGTCCAAATGCAAGCGACTCTGGGTTCCTTCAAAATCAGCTGCAGCTGCAAAAGCAGCAGGAGCCACTACCACAGCAGCAGCAGCAAGCTCTGCAACAACAATCGCATCAGGAAATGCAACATCACCTCTCAGCTAGCTGTCATGATATTGCTAATGTAGCTTCTGGTGTGTCTGAGTCTGGATCTGCTTCTCAAACAGAATCTTCTTTGCTTTCTGGGTCATCGTACCAACAGATCTATGATGGAAACAGTGGTCCAGGTCTGCATCTGCACAACGGTTTCCACAACTGTTCAAGCCAAGAGTCCTCCAACCTTCTTAATCTCTCAAGAAGTGGACAATTCATGGCATCAGAGGGATGGCCTTTGAAGAGGTTGGCTGTGGAATCTCTTTCTGGTCATGAGCTCCAACCTGTGCAGCACAAGTTTGAGAAAGTGAATCACCAAAGTAATGTGTCTCACATTTCTAGCACCTTGCCCCCACTGTCAGCAAGAGACAGTTATAGTGCCCAGGCTAGTGGTACAAATGATCAGAGTCACCTGCTTTCATCATCATTTGCAATCCATGATGGCTTGACAGCCGTCAGGAGTGGTGGTGTTGGCAGTGGAACTGATGCGATAACCATAGCTTCGTTGAGATATAATGATATGAATTTGCTACCTGAAAACCCCATCGCAACTTCCAGTTGTTTGGGCGAATCAGGAACCTTCAATTCTCTCGACGATGTGTGTGGTGTAAACCCATCACAAGGTGGAACCTTTGTGAAGGTTTACAAATCAGGGTCCCCTGGGAGATCGCTCGACATCACCAGGTTCAGCAGCTACTACGAGTTACGTAGCGAGCTCGAGCGGTTATTTGGTCTTGAAGGCCAACTGGAGGACCCTGTAAGATCAGGCTGGCAGCTTGTATTCGTTGACCGGGAAAACGATATTCTTCTCGTCGGCGATGACCCGTGGCAGGAGTTTGTGAATAGTGTATGGTGCATAAAGATCCTCTCGCCGCAAGACGTGCAGCAGATGGTCCGCGGCGGAGGCGACCTTCTGTCTACAACTGGAGTGAGGACACTGCAGGGCAGTGTCTGCGATGATTATTCTGCAGGCCACGACATGCAGAATCTCACCGGCAGCATCGCACCTGTGGTGCCTCTGGACTACTGAGACCGAGATGAAGACCAGAAACTGAAGTTCTGAACCAAAACCGGCAATTCAGCACCGCAGGATTGCCGTCCACGAGTCTTTTCGGTTCCTATGATCTATCTTCTCTCAAGTTGTGTTGGTCAGAAATAACCTAGTCGTTAATATAGCTAGATCCATTGTATCATTATGGTAATGGACATGTTGTACGATAGCTGTTGTAGCTACGTGTAGCCATAGCCTAAGCTCTAAATGGCAGGCAAGAATTGGTCTATGAAAGTATGGATGCAGGCACTCACTGTAGAGGTGACCTAGCCCTGTAGTTCTCTATATCTTCTCATATCTAAAAGCTGACGGTTCCATGTGGCGCCTAAACTATTGAACCCTGTCACCTTTGTCATATTTTTTTCACCTCAATTCGCGGTTGTTTGATCT
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